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NeuroOracle 知识图谱

交互式神经科学知识图谱,包含 86,000+ 概念、154,000+ 关系边、53,000+ 文献声明、667 条机器生成假说。

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如何使用 NeuroOracle

搜索

查找概念

在搜索栏中输入关键词(如 "hippocampus"、"dopamine"),即可在图谱中定位相关概念。结果按相关性和连接数排序。点击搜索结果可选中该节点并将视图居中到该位置。

交互

单击与双击

单击节点可在右侧面板查看详情——包括定义、别名、连接边和相关声明。双击节点可展开其邻域,在画布上显示直接相连的概念。

声明

浏览文献声明

选中一条边或节点后,可查看其底层文献声明。每条声明展示主语–谓语–宾语三元组、来源论文(PMID)、发表年份和期刊。点击 PMID 链接可直接跳转到 PubMed 查看原文。

假说

探索机器生成假说

切换到 Hypotheses 标签页可浏览 667 条机器生成的研究假说。每条假说基于图谱路径推理生成,并按新颖性、可行性和支撑证据评分。点击任意假说可查看其推理链和关联概念。

NeuroOracle 构建流程

Phase 1 — 文献抽取

从 PubMed 文献中提取结构化声明

NeuroClaw 按领域关键词(如 depression、autism、Alzheimer's)检索 PubMed 论文,使用 LLM 从摘要和全文中抽取结构化声明(claim)。每条声明包含主语、谓语、宾语三元组及来源元数据(PMID、年份、期刊)。实体名称通过 6 层解析管线(精确匹配、大小写无关、别名、模糊匹配、领域偏好)映射到 MeSH、NeuroNames、CogAt 等标准词表中的受控概念。

Phase 2 — 图谱构建

图组装与边置信度评分

抽取的声明被注入 NetworkX 有向图。每个解析后的实体成为节点,每条声明生成一条带类型、带权重的边。边的置信度由来源数量、期刊影响力、时效性和跨论文一致性综合计算。模糊谓语通过 LLM 重分类进行精炼。噪声过滤器配合 salvage 逻辑,防止低质量 LLM 抽取产物进入图谱。流水线以 12 个并行 worker 运行,单批次可处理数千篇论文。